El parque forma parte de la red hidrográfica del valle de Arinsal y el principal curso de agua es el río Pollós, que nace gracias a los diversos ríos y torrentes que bajan de la alta montaña (principalmente los ríos de Comapedrosa y del Pla de l’Estany). Conviene destacar, por su espectacularidad, las cascadas de agua de los ríos Pollós y Comapedrosa. El siguiente enlace muestra la hidrología básica del parque. Los lagos son un elemento muy importante dentro de la hidrología superficial. En el parque se pueden distinguir hasta seis núcleos diferentes de lagos, incluidos los más altos del país (concretamente el lago de Més Amunt dels Forcats, situado a 2.714 m, es el más alto de Andorra). Cabe destacar la existencia, dentro del parque, de dos captaciones comunales (Pla de l’Estany y las Fonts), que forman parte de la red de suministro de agua comunal y, por tanto, tienen un elevadísimo interés público.